जहाँ बरनी दिल्ली सल्तनत का महान विचारक था वहीं अबुल फजल भी मुगल काल, खासकर अकबर के शासन का महान विचारक था। मुगल शासन, प्रशासन का व्यवस्था, बादशाहत तथा धर्म के सबंध में जो स्टीक विचार हमें अबुल फ़जल के लेखन में मिलते है वह अन्यत्र नहीं मिल सकते। मुगलकाल में भी ‘बादशाह’ का स्थान केन्द्रीय था जिसका नियंत्रण न केवल शासन बल्कि प्रशासन पर भी था संभवतः इसी कारण अकबरकालीन मुगल साम्राज्य पहले के मुस्लिम शासकों के मुकाबले अधिक केन्द्रीकृत सुदृढ़, विस्तार तथा स्थिर साबित हुआ। बाबर द्वारा स्थापित मुगल साम्राज्य प्रभुसत्ता के तुर्क मंगोल सिद्धांत पर आधारित विचार था जिसमें बादशाह को सर्वोच्च तथा अंतिम शक्ति माना गया है।